Pathomx (korábban MetaPath) egy nyílt forráskódú grafikus szoftverek végre IPython, Qt és PyQt, célja az alapoktól kezdve, hogy mint egy interaktív segédprogram megjelenítésére és elemzésére anyagcsere adatok alapján GNU / Linux és más POSIX & nbsp; működési rendszerek. Ezt eleinte úgy tervezték, hogy feldolgozásra kell használni metabolomikára data.Features egy glanceKey szolgáltatásai közé tartozik az importáló és exportáló NMR (Nuclear Magnetic Resonance) adatokat, spektrumok feldolgozása, beleértve a normalizáció, binning és az összehangolás, valamint a metabolikus út vizualizáció és a bányászat. Ön is tudja, hogy importálni genomikai és metabolomikával adatok a különböző útvonalakon történő megjelenítés meghatározott útvonalakat.
Különböző MetaCyc adatbázis kommentárokat is szerepel a Pathomx alkalmazás, amelyek között említhetjük adatbázis egyesítése linkek, szinonimák, valamint a kapcsolódó utak és reakciók. Felhívjuk figyelmét, hogy a MetaCyc adatbázis származik a nyilvános API.
Az alkalmazás a hatékony MetaCyc adatbázis gyors feltárását komplex adatsorokat köszönhetően bővíthető és konfigurálható beépülő modulok. Ezen felül, akkor használja a Numpy és Scipy könyvtárak száma kezelése, Matplotlib az ábrázoláshoz, nmrglue az NMR-adatok importálása, d3.js interaktív grafikonok és scikit-megtanulják a statisztikai elemzés methods.Under a motorháztető és a támogatott OSesLooking a motorháztető alatt Pathomx, akkor veszi észre, hogy a kérelmet épül IPython parancssorból. Ez is jól működik a Microsoft Windows és a Mac OS X operációs rendszerekkel, amelyek esetében nem áll rendelkezésre letölthető az előre elkészített bináris csomagok. A GNU / Linux, a szoftver terjesztése csak a tömörített forráskód kompatibilis a 32-bites és 64-bites hardver platformokon.
Amikor a Pathomx, a felhasználók szem előtt kell tartaniuk, hogy az alkalmazás kihasználja az adatoknak a MetaCyc út adatbázis is, amely része a BioCyc család. A MetaCyc API előállításánál használt a mellékelt adatbázis, amely tárolja helyben.
Mi az új ebben a kiadásban:
- A teljesen új drag-drop vizuális szerkesztő adtunk.
- Ez lehetővé teszi, hogy elemzés munkafolyamatok húzza eszközök a munkaterületre, szerkesztése kapcsolatok húzza adatok sorok között eszközeinek alkalmazása, valamint inline nézetek, hogy képet kapjon az aktuális feldolgozás.
- Az adatok lehet dobni a munkaterületre azonnali import.
- Azt is hozzátette, élő per-tool haladást értesítések, bárok, és az állapot jelzők.
- A hibák vannak jelölve súgó szöveg (tooltips a szerszámokat, akkor azt piros).
követelmények :
- Graphviz
Hozzászólás nem található