RAPTOR

RAPTOR egy innovatív szoftver célja a pontos fehérje szerkezete jóslat. Egyesíti a fejlett elemzési eszközöket egy integrált szoftver megoldás, és három különböző threading módszereket. Raptor egyedi egész szám programozó optimalizálási megközelítés a leghatékonyabb felkutatására szerkezete sablonok célok alacsony szekvencia homológia és képes generálni magas minőségű modellek. A könnyen kezelhető felület és könnyen érthető E értékek ideális a kezdők és a szakértők. Mindenekelőtt az intuitív kijelző a kimenet lehetővé teszi a felhasználóknak, hogy megértsék az eredményeket egyszerűen egy pillanat alatt. Mivel a cél fehérje-szekvencia, ha van egy homológ fehérje ismert 3D szerkezet, megtalálható segítségével szekvencia keresési eszközök, mint a PSI-BLAST, is biztosított RAPTOR. A célpont szerkezet úgy építették az ismert szerkezet; Azonban, ha a szekvenciahomológia nem jelentős, azaz kevesebb, mint 25%, PSI-BLAST nem jön ki egy magabiztos hit. Ellentétben PSI-BLAST, amely egyszerűen nem sorozata kereső, fehérje threading, hajtsa elismerést, él mind homológ struktúra információt. Ez ellenőrzi a protein szekvencia egy ismeretlen szerkezetű ellen adatbázis ismert szerkezetek. Segítségével egy értékelő funkció és lebonyolítása kompatibilitási vizsgálatok között háromdimenziós struktúrák és lineáris protein szekvenciák, a legjobb strukturális sablon alapján azonosítható, amelyre építeni a sorozat szerkezetét. Ennek eredményeként a fehérje threading ad kiváló jóslat, mint homológia modellezés, amikor alig van szekvenciahomológia.

Korlátozások :

korlátozott funkcionalitással