LSim

LSim superposes makromolekuláris elektronsűrűség és kiszámítja a szerkezeti hasonlóság pontszámot. A számítások skála lineárisan a méret a molekulák hasonlítják össze.
A LSim nyomvonalakat fogalmilag független biokémiai szerkezeti elemek, és ezért vannak torzítatlan és megfelelő struktúra csak-fehérje hasonlósági vizsgálatok.
Telepítés:
Csomagolja ki a disztribúciós állományt:
tar -xzvf lsim-linux.tar.gz
Mozgasd a fájl könyvtár:
cd lsim.1.0.0
Másolás, mozgatás vagy hivatkoznak a futtatható fájl lsim megfelelő helyre -és győződjön meg arról, lsim keresztül elérhető PATH környezeti variable-, pl:
cp lsim / usr / local / bin
Állítsa változó LSIMDIR, hogy pont a választott LSim könyvtár, pl:
setenv LSIMDIR /home/olaguer/progs/lsim.1.0.0