MultiDendrograms

MultiDendrograms egy egyszerű, mégis erőteljes alkalmazás, hogy a hierarchikus Klaszterek a valós adatok, alatt terjesztett nyílt forráskódú licenc. & Nbsp; Kezdve a távolságok (vagy súlyok) mátrix, MultiDendrograms kiszámítja a dendrogramon a legelterjedtebb típusú hierarchikus csoportosítási algoritmusok , lehetővé teszi a tuning sok a grafikus ábrázolás paramétereket, és az eredmények könnyen lehet exportálni fájlba. Egy összefoglaló jellemzői:
- Multiplatform: Java-ban fejlesztett, fut minden operációs rendszerek (például a Windows, Linux és MacOS).
- Grafikus felhasználói felület: az adatok kiválasztása, a hierarchikus klaszterezés lehetőségek, dendrogramját képviselet paraméterek, navigációs egész dendrogramot, eltérés intézkedéseket.
- Hierarchikus csoportosítási algoritmusok végre: változó csoport Single rudazat, komplett Függesztőmű, súlyozatlan átlag, súlyozott átlaga, súlyozatlan súlypontja, súlyozott súlypontja és az együttes között-en belül.
- Képviselet paraméterek: méret, orientáció, címkék, tengely, stb
- Eltérés intézkedések: Cophenetic korrelációs együttható, normalizált átlagos négyzetes hiba és normalizált átlagos abszolút hiba.
- Export: ultrametric mátrix, dendrogramját részleteket szöveges és Newick fa formátumokat.
- Telek: dendrogramon kép JPG, PNG és EPS formátumban.
MultiDendrograms végrehajtja a változó csoport algoritmusok, hogy megoldja a problémát, nem egyediség megtalálható a standard pair-csoport algoritmusok és implementációk. Ez a probléma akkor merül fel, amikor két vagy több minimális távolságokat a különböző csoportosulások egyenlő során a beolvadás folyamata. A szokásos megoldás lényege, hogy válasszon egy pár, megtörve a kapcsolatok között távolságok, és a bevételek ugyanúgy, amíg a végleges hierarchikus osztályozás kapunk. Azonban a különböző clusterings lehetségesek függően alkalmazott kritérium, hogy megtörjük a kapcsolatot (általában egy pár csak a véletlenszerűen kiválasztott!).
A változó csoportot algoritmusok csoport több, mint két klaszter ugyanabban az időben, amikor kapcsolatok fordulnak elő, adott okot grafikus ábrázolása nevezett multidendrogram. A fő tulajdonságai a következők:
- Ha nincsenek kapcsolatok, a változó csoport algoritmusok ugyanazt az eredményt adja, mint a pár-csoport is.
- Ők mindig megadják a páratlan módon megoldást.
- A multidendrogram képviseletét az eredményeket lehet kifejezetten figyelembe az előfordulása kapcsolatok során agglomeratív folyamat. Továbbá, a magassága esetleges fúziós intervallum (a zenekar a program) jelzi a heterogenitás fokát belül a megfelelő klaszter.

követelmények :

• Java 2 Standard Edition Runtime Environment