Gabedit

Gabedit egy grafikus felhasználói felület Gauss, Molcas, Molpro és MPQC számítógépes kémia csomagok.
 
 Gabedit és grafikus létesítmények létrehozására kulcsszavak és opciók, molekula leírások és ther belépőcsonkok még a legfejlettebb számítási típus Gabedit tartalmaz egy speciális Molecule Builder.
 
 Akkor tudja használni, hogy gyorsan rajzolni molekulák és megvizsgálja azokat három dimenzióban. Meg lehet építeni molekulák atom, gyűrű, csoport, aminosav és nukleozid. Azt is olvastam geometria fájlból. A legtöbb nagy molekulatömegű fájlformátumot támogat.
 
 Gabedit tartalmaz egy Gauss, Molcas, Molpro és MPQC számítása beállítása ablak, amely lehetővé teszi, hogy hozzanak létre Gauss, Molcas, Molpro és MPQC munkahelyek egyszerű és közvetlen módon.
 
 Gabedit tartalmaz egy szövegszerkesztőbe szerkesztésre Molcas, Molpro, Gauss és MPQC input fájlokat.
 
 Gabedit grafikusan megjeleníteni a különböző Gauss, Molcas, Molpro, MPQC és (részben) ADF számítási eredményeket, beleértve a következőket:
 
 ย ท molekulapályák.
 ย ท felületek az elektron sűrűség, elektrosztatikus potenciál, NMR árnyékolás sűrűség, és egyéb tulajdonságait.
 ย ท felületek jelenhetnek meg, szilárd, áttetsző és dróthálót mód.
 ย ท felületeket lehet színes külön tulajdon.
 ย ท Contours (voxeleknek megfelelően, színkódolva).
 ย ท Planes (voxeleknek megfelelően, színkódolva).
 ย ท Dipól
 ย ท XYZ tengelyek és a fő tengelyei a molekulában.
 ย ท Animáció a normál üzemmód megfelelő rezgési frekvenciák.
 ย ท animáció a forgás a geometria, felület, dipól, XYZ, és a fő tengelyei a molekulában.
 ย ท Animáció kontúrok.
 ย ท Animáció voxeleknek megfelelően, színkódolva repülőgépek.
 
 Gabedit képes megjeleníteni IR és Raman spektrumok számítani. Gabedit generálhat povray fájlt geometria (atomok + kötvények, ideértve a hidrogén kötés), a felületeket (beleértve voxeleknek megfelelően, színkódolva felületek), kontúrok, voxeleknek megfelelően, színkódolva repülőgépek.
 
 Gabedit mentheti képet PPM, BMP, (JPEG) és PS formátumban. Gabedit generálhat automatikusan képsorozatot az animáció (vibráció, geometria konvergencia, forgás, kontúrok, voxeleknek megfelelően, színkódolva repülőgépek)

Mi az új ebben a kiadásban:

• Kisebb hiba javítva lett.
• NWChem is támogatott.
• A natív Windows játékok is támogatott.

Mi az új verzióban 2.3.5:

• Kisebb hibák kerültek rögzítésre.
• Az atomok lehet rögzíteni, a molekuláris dinamikai szimuláció.
• Migration Kairótól OpenGL rajz a geometria ablakban.
• Migráció gtkglarea hogy GtkGLExt.
• párhuzamosítás segítségével OpenMP.

Mi az új a 2.3.0 verzióval:

• Kisebb hibák kerültek rögzítésre.
• A felhasználó elolvashatja a pályák, a geometria és a normál üzemmód egy fchk Gauss fájlt.
• lehet olvasni a pályák az új Mopac aux fájlformátum (beleértve a tömörített formátum).
• Több új lehetőségek XYPlot és ContoursPlot ablakok (insert szöveg, vonal, nyíl, képek, új témák ...).
• A kötéshosszak lehet rögzíteni közben MD szimuláció.
• Részleges optimalizálás ma már lehetőség van a MM potenciál.
• megvalósítása eszközeként megjósolni a tömegek és bőségeknek az izotópok egy adott molekula. Végrehajtásának eszközeként, hogy kiszámolja a elektrofil, nukleofil és radikális érzékenységét egy molekula.

Mi az új a 2.2.0 verzió:

• Kisebb hibák kerültek rögzítésre
• Minden geometriai változások visszavonását és újra az Undo és Redo (u / U vagy a Ctrl z / Ctrl y)
• A felhasználó teljes ellenőrzése alatt a kötvények jelennek meg a rajzban.
• A rajz a molekula atomról atomra egyszerűsödtek.
• A rajz a molekula fragmentum fragment egyszerűsödtek.
• Gabedit olvasni összefüggőségek re gabedit, Hin, pdb, mol2 és a MOL fájlokat.
• A felhasználó beállíthatja az értéket a távolságot, kötésszög és lapszög.
• A Molekuláris dinamika konformációs keresést alkalmazásával valósul meg a MM potenciális (Amber 99).
• A Molekuláris dinamika konformációs keresést alkalmazásával valósul meg egy fél-empirikus módszer (az Open Mopac vagy PCGamess).
• Migráció GDK rajzolási funkciók Kairóba: Határon készülék Rendering vektorgrafikához.
• Cairo ma már a XYplot gabedit widgetet (használt gabedit a sorsolás spektrumok).
• Cairo ma már a geometria rajz ablak.
• Geometry lehet exportálni, EPS, PS, PDF vagy SVG fájl.
• A görbék XYplot ablakban lehet exportálni, EPS, PS, PDF vagy SVG fájl.
• Új eszköz a compute távolság 2 pont XYPlot ablakot. & Quot; Control + Shift gomb & quot; lehet használni ezt a zoomot XYPlot ablakon.
• Az új verzió a PCGamess (szentjánosbogár) most már támogatja

Mi az új verzióban 2.1.13:

• Kisebb hibák voltak fixe
• A Molekuláris dinamika konformációs keresést alkalmazásával valósul meg a MM potenciális (Amber 99).
• A Molekuláris dinamika konformációs keresést alkalmazásával valósul meg egy fél-empirikus potenciál (használ Mopac vagy PCGAMESS).
• Egy optimalizálja a geometria interaktív módon Mopac vagy PCGamess szemi-empirikus módszer, a Draw Geometria ablakban
• Migráció GDK rajzolási funkciók Kairóba: Határon készülék Rendering vektorgrafikához. Cairo ma már a XYplot gabedit widgetet (használt gabedit a sorsolás spektrumok). Cairo ma már a geometria rajz ablak.
• Geometry lehet exportálni, EPS, PS, PDF vagy SVG fájl. A görbék XYplot ablakban lehet exportálni, EPS, PS, PDF vagy SVG fájl.
• Új eszköz a compute távolság 2 pont XYPlot ablakot. & Quot; Control + bal gombját & quot; lehet használni ezt a zoomot XYPlot ablakon.
• Az új verzió a PC GAMESS / Firefly most már támogatja

követelmények :

• gtk +