CWC Simulator egy C ++ végrehajtása CWC, a fogkő képviseletére és szimuláció a biológiai rendszerek. & Nbsp; A sikeres telepítés után (lásd telepítés) akkor képes lesz futtatni szimulációk alatt CWC modellek, amint azt a néhány példát (lásd a példákat /).
(Command-line) Interface
Mivel generikus felhasználó, le kell futtatni:
-i model.cwc
-o
-t
-s
-n
-c
--qt-küszöb
-q
-w
Hol:
-
& Nbsp; - model.cwc a bemeneti CWC programot (lásd a példákat);
& Nbsp; - statisztikák az output-fájlok prefix;
& Nbsp; -
& Nbsp; -
& Nbsp; -
& Nbsp; -
& Nbsp; -
& Nbsp; -
& Nbsp; -
Output
Az eszköz termel:
- Néhány .dat fájlokat (a mintában kimenet a szimulációk)
- Néhány gnuplot szkriptek felhívni a statisztikai elemzések
Dolgozunk egy átfogó kézikönyvet.
Tulajdonságok :
- Gillespie SSA algoritmus több mint CWC modellek
- Hybrid sztochasztikus / determinisztikus szemantika
- több példánya szimulációs online statisztikákat
- Optimization többmagos architektúrák FastFlow keret
- Extensible statisztikai keretrendszer (átlag-szórás, leszűrjük csoportosítás stb.)
- Több hitelminősítő szemantika (tömeghatás, Michaelis-Menten, Hill stb.)
Hozzászólás nem található