FlexS jósolja a konformációja és orientációja egyik ligandumként képest a másik egy. A FlexS a referencia-ligandum lesz feltételezve merev, ezért meg kell adni olyan konformációban, amely hasonló a kötött állapotban. A szuperpozíció algoritmus FlexS igényel csak kis kézi beavatkozást. Tudja integrálni ezt a tudást a számításaink alapján FlexS elvégzésével egyes lépéseket kézzel. Így, FlexS tervezték interaktív munka ligandum párok, valamint a ligandum-alapú virtuális szűrés. A két legfontosabb alkalmazási területei FlexS ligand super helymeghatározás (pl. A CoMFA / QSAR) és a virtuális szűrés. Ha van egy fehérje és egy kis molekula kötelező hozzá (úgynevezett referencia-ligandum), de nem a fehérje szerkezetének, akkor megteszi a referencia szerkezet, mint a negatív ujjlenyomat az aktív hely. FlexS meghatározza a hasonlóság a vizsgálati és a referencia szerkezet hozza azokat. A virtuális szűrés, van egy referencia-dum, és egy sor vegyületek és érdekli előtérbe vegyületek kísérleti vizsgálata.
Hozzászólás nem található