MISO (izoformok elegyét) egy valószínűségi keret Pythonban, hogy kvantitatíve kifejezés szinten & nbsp; az alternatív összekapcsolódás gének RNS-szekvencia adatok, és azonosítja eltérően szabályozott izoformák vagy exonjait egész mintát.
Modellezésével generatív folyamat, amely így szól állítanak elő izoformák RNS-szekvencia, a MISO modellt használ Bayes hogy kiszámolja a valószínűsége, hogy egy olvasási származik egy adott formával.
MISO használja a kikövetkeztetett kiosztása felolvas izoformák, hogy mennyiségileg az egyedszámok a mögöttes sor alternatív mRNS izoformák. Konfidenciaintervallumokat több becslés is kapott, amely számszerűsíti a végzett becslése.
Kérjük, olvassa http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ miso kézi és dokumentációt.
követelmények :
- Python
Hozzászólás nem található