Panama új valószínűségi modell felelősségre zavaró tényezők eQTL tanulmányok, Pythonban.
Rejtett zavaró tényezők, mint például a nem megfigyelt kovariánsoknak vagy ismeretlen finom környezetvédelmi perturbációkat létrehozhat hamis hamis szövetségek vagy elfedik valódi genetikai asszociációs jeleket. Ellentétben a korábbi módszerekkel, Panama megtanulja rejtett tényezők közösen hatása kiemelkedő genetikai szabályozók. Ennek eredményeképpen, ez az új modell pontosabban megkülönböztetni a valódi genetikai egyesület jeleket a zavaró variáció.
N. Fusi, O. Stegle és ND Lawrence, "Közös modellezése zavaró tényezők és a kiemelkedő genetikai szabályozók nagyobb pontosságot a genetikai vizsgálatok genomika", PLoS Computational Biology, 2012
További információk a http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.html
Requirements:
- Python
Hozzászólás nem található