Az orsó egy alternatív megközelítés a biológiai alapú azonosítás hossza riboszóma RNS (rRNS) génrégiók. Általában nyomvonalakat primer rRNS gén szekvenciákat a különböző fajok mutatják váltakozó régiók nukleotid védelmi és variáció, mind a nukleotid szubsztitúciók (általánosan "SNP-k"), és inszerciós / deléciós (indel) eseményeket. A jelenléte indels eredmények szekvenciák különböző hosszúságú és bemutatja hiányosságok a igazítás, jellemzően jelöli egy kötőjelet "-".
A koncepció a biológiai azonosítás használ rRNS gén szekvenciák a következők: konzervált régiók meghatározására használt változó szegmensek ("Spindel hipervariábilis régiók"), amelyben a kombináció szekvencia hossza jellemző egyes fajok (a "Spindel profil"). Így minden egyes faj lehet meghatározni egy egyedi numerikus profilt.
Elméletileg egy felmérés mindössze 6 hipervariábilis régiókban 20 allél egyes (vagy 11 régió 5 allél minden) is elegendő a megkülönböztetést minden eukarióta faj a Földön, amely a becslések szerint 5 és 15 millió a számuk. A gyakorlatban Spindel képes megkülönböztetni 93,3% eukarióta fajok alacsony fajon belüli változatosság és a nagy felbontású filogenetikai.
Hozzászólás nem található