BioRuby

BioRuby egységes környezetet biztosít a bioinformatika (biológia Információs tudományok).
Az objektum orientált programozási nyelv a Ruby számos olyan funkciót alkalmas bioinformatikai kutatások, például egyértelmű szintaktikai kifejezni összetett objektumok, reguláris kifejezések a szöveges kezelése olyan erős, mint a Perl-blogodba s, a legkülönbözőbb könyvtárak, beleértve webes szolgáltatás stb
Mivel a Ruby szintaxis egyszerű és nagyon tiszta, úgy véljük, hogy könnyen megtanulható kezdőknek, könnyen használható biológusok, és elég erős a szoftverfejlesztők.
Ebben BioRuby, a fejlesztő lehet letölteni biológiai adatbázis bejegyzéseit egyszerű fájlok, internetes web szerverek és a helyi relációs adatbázisok.
Ezek az adatbázis-bejegyzést is elemzett kivonat szükséges információt. Biológiai szekvenciák lehet kezelni a kiteljesedett módszerek a Ruby & blogodba s karakterlánc osztály és a reguláris kifejezések.
A könyvtár lehet integrálni eszközök, mint a robbanás, Fasta, Hmmer és sok más szoftvercsomagok biológiai elemzés.
 BioRuby támogatja a legnagyobb biológiai adatbázis formátumok és számos módon való betekintés őket flatfile indexelés, SQL, web szolgáltatások, stb Különböző internetes szolgáltatások, beleértve Kegg API könnyen hasznosítható BioRuby.

Tulajdonságok :

• BioRuby shell
• API
• Dokumentáció

követelmények :

• Ruby 1.8.7 vagy magasabb