Kell Bioinformatika Mert Linux
géb egy Python API olvasásához bináris adatok felhasználásával létrehozott fájlokat a Goby next-gen adatkezelési keretet.Normális esetben ez a könyvtár csomag része a teljes Goby csomagot, elérhető:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/A csomag tartalmazza...
HTSeq egy Python keretet adatok feldolgozására, elemzésére a nagy áteresztőképességű szekvenálás (HTS) vizsgálatokban. követelmények : < li>...
A Jmol egy nyílt forráskódú, többplatformos és ingyenes grafikus szoftver, amelyet eredetileg úgy tervezték, hogy molekuláris nézőként működjön a 3D kémiai struktúrákban. Négy önálló módban fut, mint egy HTML5 webalkalmazás, egy Java program, egy...
LSim superposes makromolekuláris elektronsűrűség és kiszámítja a szerkezeti hasonlóság pontszámot. A számítások skála lineárisan a méret a molekulák hasonlítják össze.A LSim nyomvonalakat fogalmilag független biokémiai szerkezeti elemek, és ezért vannak...
MacMolPlt egy modern grafikus program ábrázolásakor 3-D molekuláris szerkezetek és a normál üzemmód (rezgés). Modern...
MACS2 egy modell alapú analízis eszköz CHIP-szekvencia adatok.A javulás a szekvenálás technikák, kromatin immunprecipitációt követően nagy teljesítményű szekvenálás (chip-szekvencia) egyre népszerűbb, hogy tanulmányozza genomot DNS-fehérje kölcsönhatások....
massXpert tömegspektrometria csomag egy tömegspektrometria környezet, a lineáris (bio-) polimerek. Örökli az összes újítását GNU polyxmass, mint ez a port a projektnek, hogy a cross-platform fejlesztői környezet. Mi az új ebben a kiadásban: ...
MetagenomeDB egy Python könyvtár célja, hogy könnyen tárolni, letölteni és jegyzetekkel metagenomic szekvenciák. & Nbsp; MetagenomeDB járnak, mint egy absztrakciós réteg a tetején egy MongoDB adatbázisban. Ez egy API létrehozni és módosítani, és...
MISO (izoformok elegyét) egy valószínűségi keret Pythonban, hogy kvantitatíve kifejezés szinten & nbsp; az alternatív összekapcsolódás gének RNS-szekvencia adatok, és azonosítja eltérően szabályozott izoformák vagy exonjait egész mintát.Modellezésével...
mpiBLAST egy MPI alapú párhuzamos végrehajtása NCBI BLAST. A projekt keretében egy pár programok cserélje formatdb és blastall verziókkal, hogy végre BLAST munkahelyek, párhuzamosan egy csoportja számítógépek MPI telepítve. Két fő előnye, hogy...
