MACS2 egy modell alapú analízis eszköz CHIP-szekvencia adatok.
A javulás a szekvenálás technikák, kromatin immunprecipitációt követően nagy teljesítményű szekvenálás (chip-szekvencia) egyre népszerűbb, hogy tanulmányozza genomot DNS-fehérje kölcsönhatások. Hiányának kezelése a hatékony csipen-szekvencia elemzési módszert mutatunk be egy új algoritmust, elemzi modell-alapú elemzési Chip-szekvencia (MACS), azonosítására átirat faktor kötőhelyek. MACS rögzíti a befolyása genom összetettségét, hogy értékelje a jelentőségét dúsított ChIP régiók, és a MACS javítja a térbeli felbontása kötőhelyek révén ötvözi az információkat mindkét szekvenálás tag helyzete és iránya. MACS könnyen használható CHIP-szekvencia adatok önmagukban, vagy kontroll mintát a növekedés jellegét.
követelmények :
- Python
Hozzászólás nem található