Felső Bioinformatika Mert Linux
OpenElectrophy egy keretet, hogy megkönnyítsék kezelését, tárolását és elemzését elektrofiziológiai adatok. Ez képes adatokat importálni sok fájlformátumot és tárolja azokat egy SQL-típusú adatbázis.Elemző eszközök szerepelnek OpenELectrophy a oszcilláció...
A tőzeg programcsomag készítéséhez, előre és elemzése biofizikai jellemzői fehérjék.Lásd http://enzyme.ucd.ie/PEAT dokumentációs, utasítások, screenshotok, stb. követelmények : ...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) egy hatékony programot, amely illeszkedik a viszonylag rövid nukleotidszekvenciák ellen egy hosszú referencia szekvencia, mint amilyen az emberi genom.A szoftver valósít meg a két algoritmus, BWA-short és a BWA-SW. Az egykori...
SSuMMo a könyvtár a funkciók köré iteratív segítségével hmmer rendelni szekvenciák ismétlésekkel. & Nbsp; eredmények igencsak jegyzetekkel mutató fákat faj / genus belüli elosztása a közösségben.Programok tartalmazza a forráskódot közé eszközöket: --...
géb egy Python API olvasásához bináris adatok felhasználásával létrehozott fájlokat a Goby next-gen adatkezelési keretet.Normális esetben ez a könyvtár csomag része a teljes Goby csomagot, elérhető:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/A csomag tartalmazza...
PySCeS a projekt által kifejlesztett Triple-J csoport Molecular Cell Physiology & nbsp; annak érdekében, hogy megpróbálja modell és megérteni a bonyolult folyamatok és rendszerek alkotják, melyeket az élő sejtben. Tulajdonságok : A szöveges alapú...
Pysam egy Python modul az olvasás és manipulálni Samfiles. & Nbsp; Ez egy könnyű burkolata samtools C-API.A gyors üzembe helyezési útmutató itt van. További részletes dokumentáció itt érhető el.Kérdések és megjegyzések nagyon szívesen, és meg kell...
TRMiner egy Python segédprogram, amelynek célja a tudományos adatok kurátorok. & Nbsp; Lehetővé teszi, hogy gyorsan szilva nagy gyűjtemények tudományos publikációk a mondatokat releváns az adott bányászati célt.Ez úgy érhető el két lépésben. Először is,...
Seal egy Python modult, amely szekvenciaillesztési a Hadoop.Seal egy a MapReduce kérelmet biológiai szekvenciaillesztési. Ez fut a Hadoop (http://hadoop.apache.org) keresztül Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), a Python MapReduce és HDFS API for...
avalanchetoolbox egy eszköztár azonosítására és leírására elágazó folyamatok, így például az ideg- lavinák. követelmények : ...
