Legjobb Bioinformatika Mert Linux
Genepidgin egy lakosztály Python eszköz, ami támogatja az értékelés és hozzárendelés gén terméke nevét. & Nbsp; Három fő részből áll:genepidgin * tisztább *& Nbsp; egységesíti gént nevű per UNIPROT elnevezési útmutatásokatgenepidgin * összehasonlítani *&...
lépések a csomag pontos sztochasztikus szimulációja reakció-diffúzió rendszerek tetszőlegesen összetett 3D geometriák. Fő szimulációs algoritmus egy megvalósítása Gillespie SSA, terjeszteni kezelni a diffúziós molekulák az elemek felett egy 3D tetraéderes...
TRMiner egy Python segédprogram, amelynek célja a tudományos adatok kurátorok. & Nbsp; Lehetővé teszi, hogy gyorsan szilva nagy gyűjtemények tudományos publikációk a mondatokat releváns az adott bányászati célt.Ez úgy érhető el két lépésben. Először is,...
A bioinformatika Benchmark rendszer egy kísérlet arra, hogy egy ésszerű tesztelési keretrendszer, tesztek, és az adatok, hogy lehetővé tegye a végfelhasználók és kereskedők, hogy a szonda teljesítménye a rendszereket.Amit mi próbálunk tenni, hogy hozzon...
Staden egy teljesen kidolgozott DNS-szekvencia összeszerelés (Gap4), szerkesztő és elemző eszközök (spin) Unix, Linux, MacOSX és MS Windows.A Gap4 előtt már több kisebb csatlakozott ehhez kapcsolódójavítását hogyan pontszámok csatlakozik Keresse Belső...
AREM egy alapul MACS (modell alapú vizsgálata chip-szekvencia adatok).Nagy áteresztőképességű szekvenálás összekapcsolt kromatin immunoelektroforézissel csapadék (chip-Seq) széles körben használják a jellemzésére genomot kötési minták a transzkripciós...
seriesoftubes egy kiterjesztett csővezeték Solexa Chip-seq adatok.Csomag Dokumentáció
követelmények :
...
MetagenomeDB egy Python könyvtár célja, hogy könnyen tárolni, letölteni és jegyzetekkel metagenomic szekvenciák. & Nbsp; MetagenomeDB járnak, mint egy absztrakciós réteg a tetején egy MongoDB adatbázisban. Ez egy API létrehozni és módosítani, és...
Seal egy Python modult, amely szekvenciaillesztési a Hadoop.Seal egy a MapReduce kérelmet biológiai szekvenciaillesztési. Ez fut a Hadoop (http://hadoop.apache.org) keresztül Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), a Python MapReduce és HDFS API for...
MISO (izoformok elegyét) egy valószínűségi keret Pythonban, hogy kvantitatíve kifejezés szinten & nbsp; az alternatív összekapcsolódás gének RNS-szekvencia adatok, és azonosítja eltérően szabályozott izoformák vagy exonjait egész mintát.Modellezésével...
