A bioinformatika Benchmark rendszer egy kísérlet arra, hogy egy ésszerű tesztelési keretrendszer, tesztek, és az adatok, hogy lehetővé tegye a végfelhasználók és kereskedők, hogy a szonda teljesítménye a rendszereket.
Amit mi próbálunk tenni, hogy hozzon létre egy keretet a tesztelés, és a alapvizsgálatokat hogy minden letöltheti és használhatja, hogy a szonda specifikus elemek rendszerek teljesítményét.
Sőt, a forrástól ezek a tesztek GPL, és házigazdája a Bioinformatics.org és skálázható Informatikai LLC Az ötlet az, hogy a végfelhasználók, a fogyasztók, a rendszerek fejlesztői, és mások is könnyen épít, és használja érdemi vizsgálat mérő- és tuning okok .
Joe Landman re skálázható Informatikai Kft fogant az ötlet, és írta az eredeti kódokat. Keresünk további benchmark kódot javaslatokat, tesztek, adatokat, stb
Jelenlegi alapvonal tesztek több NCBI BLAST fut, több HMMer fut, és a különböző mások. Azt tervezzük, hogy tartalmazza ClustalW, X! Tandem, különböző vegyszerek, dinamika, valamint a kapcsolódó vizsgálatokat, valamint sokan mások.
Tesztek, mint LINPACK vagy HPL egyszerűen nem nyújtanak érdemi teljesítménymutatók vagy a prediktív modellek nagy teljesítményű informatikai. Sajnos, és nem több újabb és célzottabb vizsgálatok.
Ez egy olyan probléma, mint LINPACK és HPL kifejezetten teljesítményének vizsgálatára a különböző mátrix műveletek, ahol ténylegesen rendszeres memória-hozzáférést minták, és konkrét matematikai műveleteket.
Ezek a kódok leghasznosabb képest kódokat nehéz lebegőpontos műveletek és hézagos memória forgalom. Ezek a kódok nem arra tervezték, átfogó rendszerek benchmarking, ahol disk I / O, memória késleltetés, és egyéb tényezők mind hozzájárulnak a teljesítmény problémák.
A legjobb vizsgálatok azok, amelyek a leginkább hasonlít a kódokat akkor fut a gépen. A tesztek magukat ésszerűnek kell lennie közelítések egy igazi végrehajtása a kódot, a valós adatokat. Szükség lehet hogy vág vissza annak érdekében, hogy reális távon alkalommal.
El kellett volna ésszerű részhalmaza adatok méretben. Egyetlen teszt nem mondja meg, hogyan a rendszer mérlegek, és az egyik oka a léte ez a vizsgálat kifejezetten lehetővé teszi, hogy teszteljék a teljesítményt, miközben növeli a különböző aspektusait a munkát.
Ritkán kap egy nyugalmi rendszer egy fürt, ezért azt javasoljuk, hogy próbálja meg futtatni a reális működési környezetet, mint lehetséges. Az alapvonal nyugvó rendszer rendben van, de lehet állítani a várakozásokat indokolatlanul.
top
Hozzászólás nem található